Also diese Probleme gibt es mit Logic und der internen Festplatte auch manchmal, was sich aber meist beim 1. oder 2. Abspielversuch an der Stelle dann irgendwie wieder erübrigt, das Problem tritt dann während des weiteren Arbeitens am Projekt meist nicht mehr auf.
Das Problem kann man dann auch noch etwas mildern, indem man den Airport abschaltet und Bluetooth falls nicht verwendet, abschaltet, und den Suchdienst so eingrenzt, dass er nicht die Arbeitsverzeichnisse sondern nur bestimmte Ordner indexiert. Das könnte sich ggf. auch bei Protools positiv auswirken, probiere es mal. Was bei Logic immer hilft : Projekte auf eine kleine, muss nicht mal schnelle, externe USB Platte auslagern, einfach so ein 2,5 Zoll Teil was nur 1 USB als Strom braucht.