Die Spielwiese ist groß, erlaubt ist was gefällt.
Wenn du noch ein SM58 hast, würde ich versuchen ein Mikro auf die Vorderseite des Cajon zu richten um den "Snare Sound" möglichst schön zu erwischen und eines hinter dem Cajon zu platzieren für den Kick.
Dann noch bei einem der beiden die Phase drehen und dann nach Belieben den Snare und Kick-Sound formen.
Es gibt unzählige HowTo Record a Cajon in YouTube ...
Wenn ein Cajon im Raum gut klingt kann man auch ein Mikro mit etwas mehr Abstand passen.
In deinem Fall: Einfach machen und Erfahrungen sammeln, vor allem nicht verkopfen und immer dran denken, ein guter Song und die Performance ist viel wichtiger.