Das kommt halt auf mehrere Dinge an und kann so pauschal nicht beantwortet werden.
- Anbindung Deines USB3 Chips an den Chipset (Northbridge oder so ...)
- Performance von Deinem USB 3 Chip im Lappi
- Performance des Controllers in dem externen Festplattengehäuse
- Performance der SSD
Wenn Du die SSD direkt an den PCIe Bus anschliesst vermeidest Du zusätzliche Komplexität und etwaige Performance Bremsen.
Ich fand das auch nicht so toll, dass SATA6 Controller unterschiedliche Performance haben und dass ein SAT6 Controller angeschlossen an PCIe x4 nicht performt wie Tier, weil das mainboard design restriktionen auferlegt. Zwar ein x4 Sockel, aber nur mit PCIe 1.0 Lanes (256 in beide Richtungen).
Da auch SSDs unterschiedliche Performance haben, müsstest Du also einen benchmark im Internet findet, der mit genau dem gleichen SSD Modell die Performance am SATA Bus direkt und dann via USB3 Gehäuse testet ....
Das dürfte schwierig werden ... viel Spass beim Suchen ...