Jedes Plugin benötigt umgangssprachlich gesprochen eine gewisse Zeit und das Audiosignal zu bearbeiten. Diese Zeit ist bei jedem Plugin unterschiedlich.
Nutzt Du nun viele Effekte, würden Deine Audiosignale alle verschieden lang verzögert, abhängig davon, welche und wie viele Effekte Du jeweils nutzt.
Der automatische Latenzausgleich korrigiert das, ohne daß Du etwas tun musst. Alle Spuren erklingen unabhängig von den Effekten zur richtigen Zeit.
Ähnlich ist es bei Aufnahmen. Deine Soundkarte benötigt Zeit um die ausgegebenen und aufgenommenen Audiosignale zu verabeiten. Auch dadurch würden Deine aufgenommenen Spuren sich gegenseitig verschieben. Dies wird ebenfalls durch die gängigen Sequenzer ausgeglichen.