Ich würde das nicht so betrachten.
Firiewire ist ein extrem leisungsfähiges Datenprotokoll, das speziell für Audio und Video optimiert ist.
Vorteile sind Universelle Einsetzbarbeit, Mobilität (Laptop) und schnelles an- und abschliessen (Hot-Plug)
Nachteile sind eine Begrenzte Datenbandbreite (ca. 30 Audiokanäle bei 48 kHz dürften gehen).
Hier Punktet PCI, das ja auch eine Steckkarte zusätzlich benötigt. Die kann man halt nicht so einefach rein und rausstecken und am Laptop geht es garnicht.
Es hängt also davon ab, was man braucht.
Wenn Du mal über 20 Audiokanäle gleichzeitig aufnehmen willst macht eine PCI-Löung Sinn (sofern sie passend erweiterbar ist)
Wenn dir 16 Kanäle reichen, passt Firewire und Du wirst nie Probleme haben.