Schaue dir mal dbpoweramp Converter an. Das Teil ist kostenlos und kann so ziemlich alles hin-und her konvertieren.
Mitunter ist das aber gar nicht erforderlich, da nahezu alle Programme direkt mit Mp3s umgehen können bzw. das On the Fly decodieren. Wenn du aus mp3s eine normale AUdio CD brennen willst, ist das auch kein Problem da nahezu alle Brennprgramme das unterstützen.
Winamp, Xmms usw. können natürlich auch direkt anstatt auf die Soundkarte als Wave File schreiben. Für spezielle Umwandlungen musst du aber auf andere Tools zugreifen (wie z.B. das oben beschriebene).