das muß irgendwas am "Material" oder "Innenleben" der Bauteile sein, denn nehmen wir doch einfach mal 2 Beispiele:
-der 1. Commodore C64 hat einen SID-Chip für Audio, dieser wurde warum auch immer irgendwann verändert und bei dem C64 der eher den Look des C128 oder Amiga500 hatte mWn nochmals und schon ab der 1. Änderung waren bestimmte Sounds nicht mehr identisch
-TB303-Nachbauten, egal ob 3rd-Party oder Roland, klingen dezent anders (war das nicht sogar unter den ersten TB-303-Modellen Original-Roland auch?)
kA was da was macht, aber irgendwas ist da mysteriös dran/drin (Scully, Mulder, kommt mal nachschauen...)